逐鹿之战以后，东皇太一入主九天居天皇之位。他一上位就建立了远古天庭，并且对逐鹿之战的功臣进行册封，在洪荒时期建立了一个森严的制度。而众圣及其后裔被划分为灵类。

不仅如此，东皇太一还在九天之上，建立了南天门，布下混元河洛大阵和周天星斗大阵以保天庭安全。

而东皇太一座下五位弟子，助东皇太一统领灵类，被人称为五御大帝！

他们分别是统御万天玉皇大帝，统御万神勾陈大帝，统御万灵青华大帝，统御万雷长生大帝和统御万星紫微大帝。

为了避免逐鹿之战战死的亡魂不入轮回为祸世间，东皇太一以巨钟在九幽地底开辟出一方虚空世界，称为冥界。设立阴曹地府，统御冥类。将逐鹿之战擒拿的以神荼，郁垒为首的战俘降卒册封为阴神，由阴神受命节制大地，猎守巡查所有不肯入幽冥的亡魂。

而远古部落之中那些由女娲点化而成的泥土、灵水所化种族划分为人类，其以炎黄两脉所传后人及九黎族后人为主，他们受轩辕黄帝统领。

而远古部落当中的洪荒异兽，远古妖族划分为兽类，而轩辕黄帝巡狩，至海滨而得白泽神兽。白泽口吐人言，达万物之情，黄帝因问天下鬼神之事，自古精气为物、游魂为变者凡万一千五百二十种。白泽言之，黄帝令以图写之，以示天下，统御兽类！

正当整个洪荒时代处于一片和平时，盘古的化身鸿钧道人门下一名弟子叛出师门。

该弟子名叫元祖天魔，他因三尸未斩，心生恶念被鸿钧道人逐出师门。被逐出师门以后，元祖天魔勾结以刑天为首蚩党发动暴乱。

刑天本就与蚩尤交情匪浅，然后又受到元祖天魔的挑唆，心生魔念。手持干戚杀上了黄帝的宫殿。

黄帝与刑天在常羊山激斗，刑天一时不备，被黄帝砍下头颅。黄帝将刑天的头颅封印在常羊山内，刑天大怒，施幻化之术，把化作眼睛，把肚脐化作嘴巴，想要与黄帝再决高下，黄帝不愿杀之，便施法把刑天困在了常羊山。

刑天被困在常羊山，万念俱灰，最终丢弃干戚，倒地而亡。

刑天死后，元祖天魔顺利成了这帮蚩尤余党的领袖，他具有魔化洪荒人族的力量，所以他带领蚩尤余党不断壮大，不断地吞并黄帝的部落。